Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh11Q9QYF1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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Rdh11Q9QYF1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Rdh11Q9QYF1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rdh11Q9QYF1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms