Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Pdzd4Q9QY39 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Pdzd4Q9QY39 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Pdzd4Q9QY39 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Pdzd4Q9QY39 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Pdzd4Q9QY39 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Pdzd4Q9QY39 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Pdzd4Q9QY39 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Pdzd4Q9QY39 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Pdzd4Q9QY39 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Pdzd4Q9QY39 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Pdzd4Q9QY39 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Pdzd4Q9QY39 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdzd4Q9QY39 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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