Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb11Q9QY30 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms