Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms