Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA2

Qtrt1, Queuine tRNA-ribosyltransferase catalytic subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Qtrt1Q9JMA2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Qtrt1Q9JMA2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Qtrt1Q9JMA2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms