Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scamp4Q9JKV5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scamp4Q9JKV5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms