Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nova1Q9JKN6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms