Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms