Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms