Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG6

Tmem47, Transmembrane protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem47Q9JJG6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem47Q9JJG6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem47Q9JJG6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem47Q9JJG6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms