Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riox1Q9JJF3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms