Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt1Q9JIF0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms