Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2ird1Q9JI57 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms