Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms