Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3bQ9ES34 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3bQ9ES34 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms