Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cse1lQ9ERK4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cse1lQ9ERK4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cse1lQ9ERK4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cse1lQ9ERK4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cse1lQ9ERK4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cse1lQ9ERK4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cse1lQ9ERK4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cse1lQ9ERK4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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