Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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Ndst3Q9EQH7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndst3Q9EQH7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Ndst3Q9EQH7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Ndst3Q9EQH7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Ndst3Q9EQH7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms