Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufs3Q9DCT2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufs3Q9DCT2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufs3Q9DCT2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufs3Q9DCT2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufs3Q9DCT2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufs3Q9DCT2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ndufs3Q9DCT2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ndufs3Q9DCT2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufs3Q9DCT2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufs3Q9DCT2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms