Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc38a3Q9DCP2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc38a3Q9DCP2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms