Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifi35Q9D8C4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms