Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chmp4bQ9D8B3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms