Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
U2af1Q9D883 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms