Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc81Q9D5W4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms