Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms