Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ubxn11Q9D572 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.3 ms