Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms