Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lonrf3Q9D4H7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms