Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc1Q9D4H2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gcc1Q9D4H2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcc1Q9D4H2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms