Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp35Q9D384 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms