Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q9D2Q3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D2Q3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D2Q3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D2Q3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D2Q3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D2Q3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D2Q3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D2Q3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D2Q3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D2Q3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D2Q3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms