Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms