Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbm8aQ9CWZ3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms