Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud1Q9CUB6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud1Q9CUB6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud1Q9CUB6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms