Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhobtb3Q9CTN4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms