Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ykt6Q9CQW1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ykt6Q9CQW1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms