Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms