Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQF4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQF4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQF4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CQF4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQF4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQF4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms