Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ergic3Q9CQE7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ergic3Q9CQE7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ergic3Q9CQE7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ergic3Q9CQE7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ergic3Q9CQE7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ergic3Q9CQE7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ergic3Q9CQE7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ergic3Q9CQE7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms