Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bcl11bQ99PV8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Bcl11bQ99PV8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms