Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc24a3Q99PD7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc24a3Q99PD7 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms