Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Rims1Q99NE5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms