Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a8Q99N10 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a8Q99N10 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms