Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnpo2Q99LG2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnpo2Q99LG2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms