Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp16Q99LG0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms