Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Reep3Q99KK1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Reep3Q99KK1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms