Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn3Q99JH7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms