Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf3Q922U1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf3Q922U1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms