Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcdha12Q91Y18 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms