Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q91WD4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q91WD4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q91WD4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q91WD4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q91WD4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q91WD4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q91WD4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q91WD4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q91WD4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q91WD4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q91WD4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q91WD4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q91WD4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q91WD4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q91WD4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q91WD4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q91WD4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q91WD4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q91WD4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q91WD4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q91WD4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q91WD4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q91WD4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q91WD4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q91WD4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q91WD4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q91WD4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q91WD4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q91WD4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q91WD4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q91WD4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q91WD4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q91WD4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q91WD4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q91WD4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q91WD4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q91WD4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q91WD4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q91WD4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q91WD4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q91WD4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q91WD4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q91WD4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q91WD4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q91WD4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q91WD4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q91WD4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q91WD4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q91WD4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q91WD4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q91WD4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q91WD4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q91WD4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q91WD4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q91WD4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q91WD4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q91WD4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q91WD4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q91WD4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q91WD4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q91WD4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q91WD4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q91WD4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q91WD4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q91WD4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q91WD4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q91WD4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q91WD4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q91WD4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q91WD4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q91WD4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Q91WD4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q91WD4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q91WD4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q91WD4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Q91WD4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q91WD4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q91WD4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q91WD4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q91WD4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q91WD4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q91WD4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q91WD4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q91WD4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q91WD4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q91WD4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q91WD4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q91WD4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q91WD4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q91WD4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q91WD4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q91WD4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q91WD4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q91WD4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q91WD4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q91WD4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q91WD4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q91WD4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q91WD4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms