Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt25Q8VCW2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt25Q8VCW2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt25Q8VCW2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms